[Sequences]表紙を残して、表紙以外のページを全て削除する

そんなに難しくないですね。
ページ番号についてのAcrobatの仕様
最初（最小）のページ番号が『0』な事さえわかっていれば大丈夫でしょう

バッチ処理を使います
JavaScriptで
var numDocPages = (this.numPages) - 1;
this.deletePages({nStart: 1,nEnd: numDocPages });
を
実行するだけのシンプルなもの

表紙が０
ページ数から１引いた数が最後のページ番号となります

Acrobat (Japan)
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PDFの一括処理

「Sequences.zip」をダウンロード